苗木茎腐病是由半知菌球壳孢目的真菌为害造成的一种病害。该病能为害多种植物，一年生银杏苗最易感病，死苗率达80%以上。
不同的苗木感病后，其症状不尽相同，但一般表现为茎腐。如银杏苗一年生苗感病后，初期症状是茎基部变为褐色，叶片失去正常的绿色，稍向下垂，病部迅速向上发展后，全株枯死，叶片下垂不脱落。病茎皮层肥肿皱缩，韧皮组织腐烂呈海绵状或粉末状，病菌浸入木质部，使髓部变为褐色或中空。病害扩展至根部后，根皮层腐烂，如拔疫苗，仅能拔出木质部而根部皮层则会留在土壤中。二年生苗木感病或一年生苗木发病轻的，病苗地上部分死亡，当年可从基部发生新枝。夏季，土壤温度升高，苗木茎基部受高温灼伤时，病菌便侵入为害。若苗圃地低积水，苗木生长瘦弱，发病率会显著增加。
防治方法：
①选择地下水位较低，排水良好的地作苗圃容器育苗，必须用无病原菌的土壤配制营养土；坚持轮作制度，不在同一块地连续培育同一种苗木。
②杀死病原菌茎腐病菌是一种土壤寄居病菌，平时在土壤中营腐生生活。育苗前可用枯枝、枯叶、干草均匀撒在苗床上，点火焚烧，可杀死土壤中的病原菌。也可每公顷苗圃地施入石灰粉375千克或硫酸亚铁225～300千克，以抑制病原菌。
③施用腐熟肥料肥料以农家肥为主，化肥为辅。垃圾肥和堆肥、厩肥可能带菌，应堆置发酵腐熟后才能使用。
④在高温季节搭荫棚，可降低苗床温度，可使发病率减少85%以上。
⑤提高幼苗抗病力出苗期开始，每公顷苗圃用1∶1∶200波尔多液750～1125千克喷洒幼苗，使幼苗外表形成保护膜，防止病菌侵入。发病后，及时清除病苗，在病苗穴周围撒石灰粉，以防止蔓延。
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